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近日，一項新的研究結(jié)果，為新型基因編輯，基因檢測技術(shù)以及藥物研發(fā)提供了重要理論支撐。基因編輯技術(shù)，需要對遺傳物質(zhì)進行精準(zhǔn)的操控，因此需要嚴(yán)格控制實驗環(huán)境中的核酸污染。德國MB公司生產(chǎn)的核酸污染祛除試劑——PCR Clean，即用型噴霧，可直接噴灑在待清潔物品表面，高效清除核酸污染。
Argonaute (Ago)介導(dǎo)RNA或DNA引導(dǎo)的核酸抑制。雖然真核生物(eAgos)和長原核生物Ago (pAgos)蛋白的機制是已知的，但短pAgos的機制仍然是難以捉摸的。
近日，科研人員確定了來自Crenotalea thermophila (Crt)的短pAgo和相關(guān)的TIR- apaz蛋白(SPARTA)的低溫電鏡結(jié)構(gòu):一個自由狀態(tài)的rt-SPARTA (3.27 ?)，一個裝載引導(dǎo)RNA /靶DNA的rt-SPARTA (3.27 ?)，兩個具有不同TIR組織的rt-SPARTA二聚體(3.49 ?和3.50 ?)，以及一個rt-SPARTA四聚體(3.41 ?)。
相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上，文章標(biāo)題為：“Nucleic acid-triggered NADase activation of a short prokaryotic Argonaute"。
該項研究中的結(jié)構(gòu)，揭示了ct - sparta是由連接TIR葉的雙葉折疊Ago葉組成的。rt- ago含有MID和PIWI結(jié)構(gòu)域，而rt-TIR- apaz含有TIR、N-like、Linker和Trigger結(jié)構(gòu)域。結(jié)合的RNA/DNA雙鏈采用b型構(gòu)象，可被堿基特異性接觸識別。核酸結(jié)合導(dǎo)致構(gòu)象變化，因為觸發(fā)器作為一個障礙，阻止引導(dǎo)RNA 5 ' -和目標(biāo)DNA 3 ' -末端到達它們的規(guī)范口袋，這擾亂了MID結(jié)構(gòu)域并促進了rt- sparta二聚化。兩個RNA/ dna負(fù)載的rt- sparta二聚體通過它們的TIR結(jié)構(gòu)域形成一個四聚體。四個Crt-TIR組裝成兩個平行的，頭尾相連的TIR組織，表明nadase活性構(gòu)象。
該項研究結(jié)果揭示了短pAgos防御入侵核酸的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)，并為優(yōu)化基于sparta的可編程DNA序列檢測提供了見解。
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